Bordeaux Protéomique Transfert

Savoir-faire

En lien étroit avec la Plateforme Protéome du Centre Génomique Fonctionnelle Bordeaux, Bordeaux Proteomique transfert (BPT) met à la disposition de la communauté scientifique académique et industrielle son expertise dans le domaine de l’analyse des protéines par spectrométrie de masse. Plus spécifiquement, BPT propose des services dans le domaine de la séparation des protéines par électrophorèse, l’identification, la quantification et la caractérisation des protéines par spectrométrie de masse.

S’appuyant sur une plateforme labellisée ISO 9001 version 2015 et NFX 50-900 version 2016 (norme française organisationnelle spécifique aux plateformes technologiques), BPT offre l’accès à des instruments de dernière génération tant dans le domaine de la spectrométrie de masse que dans celui du traitement bio-informatique des données générées.

Secteurs d'activité

• Laboratoires académiques
• Industrie des secteurs biotechnologiques, pharmaceutiques, et agro-alimentaires
• Secteur non académique en lien avec le patrimoine culturel

Matériels et Moyens

• Orbitrap Eclipse (Thermo Scientific); UVPD, ETD, FAIMS, HMR, PTCR + Vanquish Neo
• Orbitrap Fusion Lumos (Thermo Electron); ETD + U3000-RSLC
• Q-Exactive (Thermo Electron); AP-MALDI ion source (TransMIT) 
• LTQ Orbitrap XL (Thermo Electron); Automate HDX (LEAP)
• Q-TRAP 5500 (Sciex) + Nexera XR (Shimadzu) 
• Logiciels : Proteome Discoverer 2.5 (Thermo Scientific) ; Algorithmes : Sequest HT (Thermo Scientific), Peaks X (Bioinformatics Solutions Inc), MS Amanda (Thermo Scientific), Mascot 2.5 (Matrix Science) ; Byonic 4.0 (Protein Metrics) ; Prosight PD